| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 田名部 琢 磨 | 青森・下長中学校 | IN | 00:43.56 | |
| 2 | 中 村 晃 大 | 青森・下田中学校 | OUT | 00:43.80 | |
| 3 | 田 口 慧 | 岩手・飯豊 | OUT | 00:44.31 | |
| 4 | 木 村 弘 | 青森・下長中学校 | OUT | 00:44.82 | |
| 5 | 中 野 秀 基 | 山形・山形第五中学校 | IN | 00:45.28 | |
| 6 | 中 野 由 基 | 山形・山形第五中学校 | OUT | 00:46.60 | |
| 7 | 大 峠 大 介 | 岩手・柳沢中学校 | IN | 00:47.12 | |
| 8 | 渡 辺 大 貴 | 福島・山木屋中学校 | OUT | 00:47.98 | |
| 9 | 古 川 耀 | 福島・熱海中学校 | IN | 00:49.12 | |
| 10 | 武 田 竜太郎 | 山形・山形第五中学校 | OUT | 00:49.15 | |
| 11 | 佐 藤 大 昂 | 岩手・滝沢第二中学校 | IN | 00:50.71 | |
| 12 | 高 橋 康 典 | 福島・山木屋中学校 | IN | 00:53.00 |